В целях обеспечения эффективного расследования преступлений террористического характера распоряжением Председателя Следственного комитета при прокуратуре РФ в составе Главного следственного управления создан отдел по расследованию преступлений террористического характера.

Кроме того, в следственных управлениях по республикам Дагестан и Ингушетия созданы совместные с республиканскими ФСБ и МВД координационно-аналитические следственно-оперативные группы, в задачу которых входит не только расследование особо тяжких преступлений и преступлений террористической направленности, но и своевременное выявление готовящихся террористических актов.